RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 HOXB2P14652 356 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 GPD1P21695 349 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 P2RY2P41231 377 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 WASP42768 502 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 COPAP53621 1224 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CDH4P55283 916 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ATP11AP98196 1134 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ALFQ53S48 1182 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FAM131BQ86XD5 332 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 APCDD1Q8J025 514 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 UCMAQ8WVF2 138 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 RNF34Q969K3 372 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CNPY3Q9BT09 278 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PARVAQ9NVD7 372 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SNX10Q9Y5X0 201 aa15.99■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CCP110O43303 1012 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 TPM3P06753 285 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PRKCHP24723 683 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CSKP41240 450 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SEMA3BQ13214 749 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 TRIM14Q14142 442 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PLK5Q496M5 336 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 RABGAP1LQ5R372 815 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 DNAJC24Q6P3W2 148 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SIK2Q9H0K1 926 aa15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 E9PAM4 449 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FAM72CH0Y354 149 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ALDH1A2O94788 518 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ASLP04424 464 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 NDUFV2P19404 249 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 GGCXP38435 758 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 OXCT1P55809 520 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FAM72AQ5TYM5 149 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SDE2Q6IQ49 451 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ANO7Q6IWH7 933 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FAM72DQ6L9T8 149 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 KBTBD6Q86V97 674 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 NLRP14Q86W24 1093 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FAM72BQ86X60 149 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CCDC185Q8N715 623 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 LOXL4Q96JB6 756 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 MCEEQ96PE7 176 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 OR12D3Q9UGF7 316 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ERVW-1Q9UQF0 538 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 RAD54BQ9Y620 910 aa15.97■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 C10orf142B7Z368 130 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 H0Y626 953 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 IGLV3-19P01714 112 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 MYBL1P10243 752 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 AIF1P55008 147 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CDH18Q13634 790 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 FRMD1Q8N878 549 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 RUBCNQ92622 972 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PSMB7Q99436 277 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 TRIM7Q9C029 511 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CIPCQ9C0C6 399 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 PRSS16Q9NQE7 514 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 ITM2CQ9NQX7 267 aa15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
BECN1-211ENST00000589636 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms