RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CACUL1	Q86Y37	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RAD54L	Q92698	747 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF2C	Q99661	725 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KCND2	Q9NZV8	630 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PQD8	194 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MYMK	A6NI61	221 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	WASH3P	C4AMC7	463 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RGS13	O14921	159 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	AP5Z1	O43299	807 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	COCH	O43405	550 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HUS1	O60921	280 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLITRK5	O94991	958 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IL18RAP	O95256	599 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	F13B	P05160	661 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ADM	P35318	185 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXD12	P35452	270 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GRIK1	P39086	918 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PNPLA4	P41247	253 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GRIA2	P42262	883 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF10	Q12962	218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74

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