RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 PLXNA2O75051 1894 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 GPD2P43304 727 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 NUCB2P80303 420 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 IL9RQ01113 521 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 CCDC157Q569K6 752 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 KLHL10Q6JEL2 608 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 BEND5Q7L4P6 421 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TAC4Q86UU9 113 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SLC6A18Q96N87 628 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 DKK4Q9UBT3 224 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 FTSJ1Q9UET6 329 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.75■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 A0A1B0GTQ1 180 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TTC34A8MYJ7 566 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SLC8A1P32418 973 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ECT2LQ008S8 904 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 LGI2Q8N0V4 545 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 MAN1B1Q9UKM7 699 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 RAXQ9Y2V3 346 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.74■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 BICDL2A1A5D9 508 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 KRT5P13647 590 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 KCNH2Q12809 1159 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SYPL2Q5VXT5 272 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TTI2Q6NXR4 508 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 CHSY1Q86X52 802 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 STK32AQ8WU08 396 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 NELFBQ8WX92 580 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24.73■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 MED7O43513 233 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 GNA14O95837 355 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ADH1BP00325 375 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TACR2P21452 398 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 NNMTP40261 264 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 PSMD8P48556 350 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ACAP1Q15027 740 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 PDZD3Q86UT5 571 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 KREMEN1Q96MU8 473 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 MED15Q96RN5 788 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 FAM129BQ96TA1 746 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 POPDC2Q9HBU9 364 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.72■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 F5H5T6 163 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 GOT1P17174 413 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ABCB4P21439 1286 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 C5AR1P21730 350 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 CD38P28907 300 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 CCR5P51681 352 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SLC12A1Q13621 1099 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 MEA1Q16626 185 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 DENND1BQ6P3S1 775 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 MARCH9Q86YJ5 346 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 APCDD1Q8J025 514 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 EBF2Q9HAK2 575 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 ITPR1Q14643 2758 aa24.71■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PBX1-217ENST00000559578 FASNP49327 2511 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 FAM149AA5PLN7 773 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 AFPP02771 609 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 CYP4F3Q08477 520 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 SLC45A4Q5BKX6 768 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 DHRS13Q6UX07 377 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 GATAD2AQ86YP4 633 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 TRIM59Q8IWR1 403 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 STK40Q8N2I9 435 aa24.7■■□□□ 1.54
PBX1-217ENST00000559578 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms