RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CPA3P15088 417 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 VHLP40337 213 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 GPSM1Q86YR5 675 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 LGI2Q8N0V4 545 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 DPP10Q8N608 796 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CAVIN3Q969G5 261 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 NEK6Q9HC98 313 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 THAP1Q9NVV9 213 aa6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PDE4D-226ENST00000546160 TNNI3P19429 210 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 WEE1P30291 646 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CDC25CP30307 473 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLC1A6P48664 564 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CCT8P50990 548 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RTP1P59025 263 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CNGA2Q16280 664 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NTRK3Q16288 839 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC142Q17RM4 750 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PARP6Q2NL67 630 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SEZ6Q53EL9 994 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GPR142Q7Z601 462 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IFNEQ86WN2 208 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 WDR48Q8TAF3 677 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SPACA7Q96KW9 195 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PNKPQ96T60 521 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TKTL2Q9H0I9 626 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SNX6Q9UNH7 406 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BCL9LQ86UU0 1499 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FKBP6O75344 327 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SERPINI2O75830 405 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GLI1P08151 1106 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 USP17L7P0C7H9 530 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 MYBL2P10244 700 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ACADSP16219 412 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ATP6V1C1P21283 382 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CTNNB1P35222 781 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GPR15P49685 360 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RAD23AP54725 363 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 XRCC4Q13426 336 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NFYCQ13952 458 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 RFX8Q6ZV50 586 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 LUZP2Q86TE4 346 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CNBD2Q96M20 576 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CCT7Q99832 543 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DYTNA2CJ06 578 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FYNP06241 537 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 BDNFP23560 247 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HTR7P34969 479 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 DDR2Q16832 855 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 C11orf88Q6PI97 169 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 STMN3Q9NZ72 180 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 ADM5C9JUS6 153 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 GSTM1P09488 218 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC130P13994 396 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 PSMC3P17980 439 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 HTR1BP28222 390 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 POU6F1Q14863 301 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2A13Q16696 494 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-226ENST00000546160 EPC2Q52LR7 807 aa6.52□□□□□ -1.37
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