RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542011.1

VSIG10-208, Transcript of V-set and immunoglobulin domain containing 10, human

TSL 3

Gene VSIG10, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	LRRC72	A6NJI9	287 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ALOX15B	O15296	676 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	GJB3	O75712	270 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SEMA4F	O95754	770 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CYP11B1	P15538	503 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	C5AR1	P21730	350 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CD27	P26842	260 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	GRIA4	P48058	902 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CDH4	P55283	916 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	GLRX5	Q86SX6	157 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ERICH1	Q86X53	443 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	C18orf8	Q96DM3	657 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	MYO19	Q96H55	970 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	NPY6R	Q99463	290 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	WDCP	Q9H6R7	721 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ANO10	Q9NW15	660 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	THADA	Q6YHU6	1953 aa		10.01	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	YKT6	O15498	198 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ATP9B	O43861	1147 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	MBD3	O95983	291 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CALCA	P01258	141 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	HLA-E	P13747	358 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CD59	P13987	128 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	MAPK8	P45983	427 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CXCR3	P49682	368 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CCR5	P51681	352 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CLCN6	P51797	869 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC20A2	Q08357	652 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	GRIK2	Q13002	908 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CST6	Q15828	149 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	INAVA	Q3KP66	663 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FBXL22	Q6P050	247 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	LRRC31	Q6UY01	552 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CCDC114	Q96M63	670 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	HAPLN3	Q96S86	360 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CDC6	Q99741	560 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		10	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	DRGX	A6NNA5	263 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	C10orf142	B7Z368	130 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011		F8VZ95	297 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011		M0QYT0	321 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	FLRT2	O43155	660 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	SIN3B	O75182	1162 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ERBB2	P04626	1255 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	CCDC172	P0C7W6	258 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	GOT1	P17174	413 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	KCNA4	P22459	653 aa		9.99	□□□□□ -0.81
VSIG10-208	ENST00000542011	ETFB	P38117	255 aa		9.99	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms