RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 TTC34A8MYJ7 566 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SEMA4FO95754 770 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 PDGFRAP16234 1089 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 NNMTP40261 264 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 MATKP42679 507 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 GRIK2Q13002 908 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC12A1Q13621 1099 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 C18orf8Q96DM3 657 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 PCED1AQ9H1Q7 454 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 RRN3Q9NYV6 651 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 VANGL2Q9ULK5 521 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 STAP1Q9ULZ2 295 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 A0A1B0GVM2 712 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 TCAF2A6NFQ2 919 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 F8VZ95 297 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SULT1E1P49888 294 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 OXCT1P55809 520 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CENPCQ03188 943 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FOXC1Q12948 553 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 KRT31Q15323 416 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 IGSF8Q969P0 613 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SIK2Q9H0K1 926 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 WDCPQ9H6R7 721 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SCML1Q9UN30 329 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 HS3ST4Q9Y661 456 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 GON4LQ3T8J9 2241 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 PAGE1O75459 146 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FSBPO95073 299 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 C7P10643 843 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 GGCXP38435 758 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 STK19P49842 368 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 C9orf64Q5T6V5 341 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 NPY6RQ99463 290 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SGK2Q9HBY8 427 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 PIGVQ9NUD9 493 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FANCLQ9NW38 375 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FBXL12Q9NXK8 326 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CKAP5Q14008 2032 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 UPK3BL1B0FP48 263 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 UPK3BL2E5RIL1 263 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 LSM8O95777 96 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 GABRB2P47870 512 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 KLK7P49862 253 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SHC2P98077 582 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 SULT2A1Q06520 285 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 ARID5BQ14865 1188 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CST6Q15828 149 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 C2CD6Q53TS8 623 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 PIP4P1Q86T03 277 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CPA5Q8WXQ8 436 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 CACNA1BQ00975 2339 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRJ-206ENST00000534219 FAM47DPA6NHR8 397 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 GOLGA8SH3BPF8 625 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 GFPT2O94808 682 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 ADCY5O95622 1261 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 MMEP08473 750 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 CD59P13987 128 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 DEUP1Q05D60 604 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 USP30Q70CQ3 517 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 C14orf80Q86SX3 495 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 XYLT1Q86Y38 959 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRJ-206ENST00000534219 OMDQ99983 421 aa25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 193.7 ms