RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	THTPA	Q9BU02	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BRCA2	P51587	3418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HHLA1	C9JL84	531 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL2	O95198	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GOT1	P17174	413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CYP2B6	P20813	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GSTT1	P30711	240 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FDFT1	P37268	417 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	AP2B1	P63010	937 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IRF9	Q00978	393 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MS4A2	Q01362	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GK3P	Q14409	553 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HIC1	Q14526	733 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UNC93A	Q86WB7	457 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897		H0YJX3	145 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	AP1G2	O75843	785 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	LTF	P02788	710 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	COX4I1	P13073	169 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	HOXC8	P31273	242 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	HCAR3	P49019	387 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	CLCN3	P51790	818 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	HK2	P52789	917 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	BCAR1	P56945	870 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	MXRA7	P84157	204 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	CDKL1	Q00532	357 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	SP4	Q02446	784 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	KDSR	Q06136	332 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	KLF10	Q13118	480 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	OLIG2	Q13516	323 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	PEX6	Q13608	980 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	VGLL4	Q14135	290 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	KYAT1	Q16773	422 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897		Q3C1V9	767 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	NPW	Q8N729	165 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	LGMN	Q99538	433 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	EPAS1	Q99814	870 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	CPNE1	Q99829	537 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	DRC3	Q9H069	523 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	DPP3	Q9NY33	737 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
CTSC-208	ENST00000533897	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.53	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms