RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532029.6

LRRK1-208, Transcript of leucine rich repeat kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRK1, Length 1,241 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1-208ENST00000532029 CA9Q16790 459 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 AHI1Q8N157 1196 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.94■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 K7EQS6 105 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 PI15O43692 258 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 KRT7P08729 469 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 RHOQP17081 205 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 EPHB2P29323 1055 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 CD70P32970 193 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 MAGEA9P43362 315 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 SEC13P55735 322 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 TAS2R40P59535 323 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 LMAN2Q12907 356 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 SEMA3BQ13214 749 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 GEN1Q17RS7 908 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 DAAM2Q86T65 1068 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 UCMAQ8WVF2 138 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 CLDN23Q96B33 292 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 RETREG1Q9H6L5 497 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.93■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 DAPK3O43293 454 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 KRT86O43790 486 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 RNF40O75150 1001 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 MOCS3O95396 460 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 RHOCP08134 193 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 COMTP21964 271 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 OR1E1P30953 314 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 ARL4AP40617 200 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 FZD5Q13467 585 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 SLC12A1Q13621 1099 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 KRT81Q14533 505 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 FSCBQ5H9T9 825 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 C6orf118Q5T5N4 469 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.92■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.92■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 A0A0U1RQJ8 604 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 PRRT4C9JH25 899 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 H3BRJ5 948 aa22.91■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 E2F5Q15329 346 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 DPYSL2Q16555 572 aa22.91■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 CIPCQ9C0C6 399 aa22.91■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa22.91■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 MUC3BQ9H195 1237 aa22.9■■□□□ 1.26
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LRRK1-208ENST00000532029 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 ELOVL2Q9NXB9 296 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 DONSONQ9NYP3 566 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 NEU3Q9UQ49 428 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.9■■□□□ 1.26
LRRK1-208ENST00000532029 GOT1P17174 413 aa22.89■■□□□ 1.25
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