RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 RSAD2Q8WXG1 361 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 BADQ92934 168 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 SNF8Q96H20 258 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 TMEM169Q96HH4 297 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 ZNF670Q9BS34 389 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 FAM192AQ9GZU8 254 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 TP73O15350 636 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 OAS1P00973 400 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 ITGAVP06756 1048 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 KLRC2P26717 231 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 ARL4AP40617 200 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 EFHC2Q5JST6 749 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 CCDC89Q8N998 374 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 PHC3Q8NDX5 983 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 ART4Q93070 314 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 FAM136AQ96C01 138 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 ZNF558Q96NG5 402 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 SLX1AQ9BQ83 275 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 GMEB1Q9Y692 573 aa13.15□□□□□ -0.3
ATG13-211ENST00000528494 SYN1P17600 705 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 CA8P35219 290 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ROR1Q01973 937 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 MUM1Q2TAK8 710 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 CASP10Q92851 521 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 C8orf48Q96LL4 319 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 YIPF2Q9BWQ6 316 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ADAM7Q9H2U9 754 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ABCC13Q9NSE7 274 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 GMIPQ9P107 970 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ANAPC5Q9UJX4 755 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 FBXW11Q9UKB1 542 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 NR2E3Q9Y5X4 410 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 TBX18O95935 607 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 CCNB1P14635 433 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 IZUMO3Q5VZ72 239 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SLC9A4Q6AI14 798 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ARHGAP18Q8N392 663 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 RNF139Q8WU17 664 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 PTPRN2Q92932 1015 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 CLSTN3Q9BQT9 956 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SIK2Q9H0K1 926 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 IL23AQ9NPF7 189 aa13.14□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SMAPO00193 183 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 PEX11AO75192 247 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 F9P00740 461 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ITIH2P19823 946 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 CHKAP35790 457 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 TAF10Q12962 218 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 NOMO1Q15155 1222 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 UCMAQ8WVF2 138 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 FAF2Q96CS3 445 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 PGM2Q96G03 612 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 GBP5Q96PP8 586 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 PHACTR1Q9C0D0 580 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 FBXO44Q9H4M3 255 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ETNK1Q9HBU6 452 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 WHRNQ9P202 907 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 NLRC5Q86WI3 1866 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 FGBP02675 491 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SRGAP2BP0DMP2 458 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 YWHAQP27348 245 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 MAGEA11P43364 429 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 IFNAR2P48551 515 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 PARP6Q2NL67 630 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ARL13BQ3SXY8 428 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 MON1AQ86VX9 555 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 SLC39A11Q8N1S5 342 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 FITM2Q8N6M3 262 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 FBXO32Q969P5 355 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 NUDCD1Q96RS6 583 aa13.13□□□□□ -0.31
ATG13-211ENST00000528494 MTRRQ9UBK8 725 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms