RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 PJA1Q8NG27 643 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 NEK9Q8TD19 979 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 KAT2BQ92831 832 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 MIEF2Q96C03 454 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 NDC1Q9BTX1 674 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TTPALQ9BTX7 342 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 FNIP2Q9P278 1114 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 POLHQ9Y253 713 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 MTCH2Q9Y6C9 303 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 GBF1Q92538 1859 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.66□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.65□□□□□ -1.66
HDAC2-216ENST00000523628 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC78A2IDD5 438 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DENND3A2RUS2 1198 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SMIM22K7EJ46 135 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ASAP2O43150 1006 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ARIH2O95376 493 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DEXIO95424 95 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IGHDP01880 384 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 AHSGP02765 367 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MMP1P03956 469 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 KCNA2P16389 499 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IFNAR1P17181 557 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LAG3P18627 525 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MUTP22033 750 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ABCD1P33897 745 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SCNN1GP51170 649 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 EVCP57679 992 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM111BQ6SJ93 734 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZRM9 215 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RTL10Q7L3V2 364 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RASGRP2Q7LDG7 609 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF410Q86VK4 478 aa4.65□□□□□ -1.67
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HDAC2-216ENST00000523628 GPR65Q8IYL9 337 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TCP11Q8WWU5 503 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PGBD4Q96DM1 585 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC51Q96ER9 411 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 FAM20AQ96MK3 541 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MRI1Q9BV20 369 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 APOL5Q9BWW9 433 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa4.65□□□□□ -1.67
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HDAC2-216ENST00000523628 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.65□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01553A4QN01 128 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SMCO2A6NFE2 343 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 GRM6O15303 877 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 PMM2O15305 246 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SLC16A6O15403 523 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 CYTH3O43739 400 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 NBNO60934 754 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 DTNBO60941 627 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF286BP0CG31 522 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 HDCP19113 662 aa4.64□□□□□ -1.67
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A2P23975 617 aa4.64□□□□□ -1.67
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