RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MECR	Q9BV79	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.9	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RASSF2	P50749	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MEIS3	Q99687	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.89	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	GRK5	P34947	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ADPRH	P54922	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	LTB	Q06643	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PMPCA	Q10713	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	GALNT3	Q14435	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ASIC2	Q16515	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	BECN2	A8MW95	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	DNPH1	O43598	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ABCB4	P21439	1286 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	MLH1	P40692	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	AK2	P54819	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	EGR4	Q05215	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KEAP1	Q14145	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	LZTS1	Q9Y250	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ASNA1	O43681	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	LCAT	P04180	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	LCK	P06239	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TGFB3	P10600	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	AKT1	P31749	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	POLE2	P56282	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	RHAG	Q02094	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057		Q0VFX4	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TRAF1	Q13077	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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