RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517517.1

RRM2B-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 4

Gene RRM2B, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RRM2B-204	ENST00000517517		A0A1B0GTW7	788 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517		A0A1B0GVT2	93 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	OPHN1	O60890	802 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ACADM	P11310	421 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KLK7	P49862	253 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	METAP1	P53582	386 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	FBXL22	Q6P050	247 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	BIRC7	Q96CA5	298 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ALG14	Q96F25	216 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	EBF2	Q9HAK2	575 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	TMEM131	Q92545	1883 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KNTC1	P50748	2209 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	C10orf142	B7Z368	130 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KCNK3	O14649	394 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	MID1	O15344	667 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ADCY5	O95622	1261 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SEMA4F	O95754	770 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	APOE	P02649	317 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	IGHV4-34	P06331	123 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SYP	P08247	313 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	CDH18	Q13634	790 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ACACA	Q13085	2346 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	PLXNA2	O75051	1894 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517		H0Y626	953 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	WNT9A	O14904	365 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	HSF2BP	O75031	334 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	GLI1	P08151	1106 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	GNS	P15586	552 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	CDK17	Q00537	523 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	PTK2	Q05397	1052 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	NME3	Q13232	169 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KIF19	Q2TAC6	998 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	HLA-B	Q31612	363 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	STK40	Q8N2I9	435 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	GPT2	Q8TD30	523 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	FRS2	Q8WU20	508 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SNX19	Q92543	992 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	GATA6	Q92908	595 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRM2B-204	ENST00000517517	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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