RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TTC34	A8MYJ7	566 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TBL1X	O60907	577 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PIAS2	O75928	621 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TNFSF15	O95150	251 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	GJB6	O95452	261 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ADH1B	P00325	375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ASL	P04424	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ALPPL2	P10696	532 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	DRD3	P35462	400 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NUDT1	P36639	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CSK	P41240	450 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ASPA	P45381	313 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	INHBC	P55103	352 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	STK40	Q8N2I9	435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.74	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	UBE4B	O95155	1302 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	RTN2	O75298	545 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	IL1B	P01584	269 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	THEGL	P0DJG4	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TXLNA	P40222	546 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	STAT6	P42226	847 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	AP3M2	P53677	418 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KCNMA1	Q12791	1236 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KDM1B	Q8NB78	822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.73	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276		A0A087X0B3	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276		K7ESM1	405 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	LATS1	O95835	1130 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	METAP1	P53582	386 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CLDN10	P78369	228 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	INCA1	Q0VD86	236 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	TRIM69	Q86WT6	500 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	MFN1	Q8IWA4	741 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PTPRN2	Q92932	1015 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	STIM2	Q9P246	746 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.72	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SCAMP1	O15126	338 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	EXOC3	O60645	756 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	NEBL	O76041	1014 aa		13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
FAM53C-208	ENST00000511276	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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