RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TEKT4Q8WW24 435 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC17Q96AE7 1141 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA4AQ9H3S1 761 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZWILCHQ9H900 591 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 USP18Q9UMW8 372 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ILVBLA1L0T0 632 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 DAPK3O43293 454 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MTA2O94776 668 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PROSCO94903 275 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 APBB3O95704 486 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RHOCP08134 193 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MIPP30301 263 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HLA-FP30511 346 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ARL4AP40617 200 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HCAR3P49019 387 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 GEN1Q17RS7 908 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MBLAC2Q68D91 279 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf74Q86VG3 221 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LRCH4O75427 683 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 EPHB2P29323 1055 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SGSHP51688 502 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 OGDHQ02218 1023 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC20A2Q08357 652 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 LMAN2Q12907 356 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CRY1Q16526 586 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ODF2Q5BJF6 829 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZS52 159 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC185Q8N715 623 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TSTD1Q8NFU3 115 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ATRIPQ8WXE1 791 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 IGSF8Q969P0 613 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MUC3BQ9H195 1237 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEH1Q9H213 219 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 EBF1Q9UH73 591 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP2-208ENST00000504294 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 WASH4PA8MWX3 477 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PRRT4C9JH25 899 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 H3BRJ5 948 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LRIG2O94898 1065 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXB2P14652 356 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TPI1P60174 286 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ECT2LQ008S8 904 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MANEALQ5VSG8 457 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RETSATQ6NUM9 610 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 C14orf80Q86SX3 495 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DNAAF5Q86Y56 855 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LZTR1Q8N653 840 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ALLCQ8N6M5 410 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GABRG3Q99928 467 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS28Q9UK41 221 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms