RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284		E5RJQ4	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SEPT4	O43236	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HSD3B1	P14060	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CHN1	P15882	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CPA2	P48052	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CDK18	Q07002	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	GPR162	Q16538	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CUL5	Q93034	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	CTSA	P10619	480 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RXRA	P19793	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PRPH2	P23942	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ADPRH	P54922	357 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ID2	Q02363	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	DERA	Q9Y315	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAM10	O14672	748 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ACP5	P13686	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CCT5	P48643	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284		Q4G0T1	1027 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	CLPB	Q9H078	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	STX16	O14662	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	UGDH	O60701	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PNPLA4	P41247	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	EFR3A	Q14156	821 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PGM5	Q15124	567 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	IP6K1	Q92551	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	COG8	Q96MW5	612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPRK-215	ENST00000498284	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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