RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 CDH4P55283 916 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 PTPRNQ16849 979 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 ALFQ53S48 1182 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARTNQ5T4W7 220 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRC31Q6UY01 552 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMC6Q7Z403 805 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC185Q8N715 623 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 HMGB4Q8WW32 186 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAB3Q8WWW8 586 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABHD10Q9NUJ1 306 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLA2G4CQ9UP65 541 aa18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 GFRA3O60609 400 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SRGAP2O75044 1071 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MOCS3O95396 460 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 GABRG2P18507 467 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRKCHP24723 683 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADKP55263 362 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLC12A1Q13621 1099 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLEKHG6Q3KR16 790 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 APCDD1Q8J025 514 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 PGBD3Q8N328 593 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 NTAN1Q96AB6 310 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 OSBPL2Q9H1P3 480 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 TMEM245Q9H330 911 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCINQ9Y6U3 715 aa18.39■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ASLP04424 464 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 EPHX1P07099 455 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 HLA-EP13747 358 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 DESP17661 470 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 PSMA2P25787 234 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 PLK1P53350 603 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 OXCT1P55809 520 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 STARD3Q14849 445 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEP68Q76N32 757 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR52K2Q8NGK3 314 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM7Q9C029 511 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 THAP2Q9H0W7 228 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MPP6Q9NZW5 540 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 NENFQ9UMX5 172 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa18.38■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 NDUFV2P19404 249 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUMBP49757 651 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF75DP51815 510 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCAPQ12770 1279 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 LPAL2Q16609 132 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MANEALQ5VSG8 457 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SLFN11Q7Z7L1 901 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 CNGA4Q8IV77 575 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF366Q8N895 744 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ALG14Q96F25 216 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRGPRX3Q96LB0 322 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZYG11BQ9C0D3 744 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAB23Q9ULC3 237 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERVW-1Q9UQF0 538 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 INVSQ9Y283 1065 aa18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM72CH0Y354 149 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 DCLK1O15075 740 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ST8SIA6P61647 398 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 ECT2LQ008S8 904 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM72AQ5TYM5 149 aa18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 FAM72DQ6L9T8 149 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms