RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 DEFB103AP81534 67 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GBE1Q04446 702 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 SLC1A5Q15758 541 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB6Q15916 424 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 GGA2Q9UJY4 613 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ATP6V1G1O75348 118 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 ECI2O75521 394 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 UBOX5O94941 541 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 UPP2O95045 317 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CYP11A1P05108 521 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 IL9RQ01113 521 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 STILQ15468 1287 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 BOLA3Q53S33 107 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 FAM47CQ5HY64 1035 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TMEM110Q86TL2 294 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CCDC185Q8N715 623 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 RNF169Q8NCN4 708 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 LOXL4Q96JB6 756 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CEP41Q9BYV8 373 aa7.23□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 A0A0A0MRY4 1105 aa7.22□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 TAC1P20366 129 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 AMPD1P23109 780 aa7.22□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 PHBP35232 272 aa7.22□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 NDUFV1P49821 464 aa7.22□□□□□ -1.25
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HERC4-211ENST00000492996 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 TBCBQ99426 244 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 CNTN3Q9P232 1028 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC4-211ENST00000492996 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.22□□□□□ -1.25
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