RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTKP33981 857 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUDT1P36639 197 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CASP4P49662 377 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PKNOX1P55347 436 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GJA9P57773 515 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 VAC14Q08AM6 782 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAAP100Q0VG06 881 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 COG2Q14746 738 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNX17Q15036 470 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 HID1Q8IV36 788 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEB6Q8N7X4 407 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFAP2CQ92754 450 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC39A13Q96H72 371 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAD21L1Q9H4I0 556 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TIGARQ9NQ88 270 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CHST12Q9NRB3 414 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJC12Q9UKB3 198 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSME2Q9UL46 239 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIPK3Q9Y572 518 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.05□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIK3R2O00459 728 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCNKO75909 580 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLIC3O95833 236 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCNAP12004 261 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 BMP4P12644 408 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMBIM6P55061 237 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 BFSP2Q13515 415 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CEACAM7Q14002 265 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCEAL1Q15170 157 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MSS51Q4VC12 460 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTX3Q5HYI7 312 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 FRMD5Q7Z6J6 570 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP37Q86T82 979 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDPRQ8NCN5 879 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC35C1Q96A29 364 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNX18Q96RF0 628 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 IDI2Q9BXS1 227 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MUC3BQ9H195 1237 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 USTQ9Y2C2 406 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAMB1P07942 1786 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 POTEMA6NI47 508 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 DLGAP1O14490 977 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOCS2O14508 198 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 AXIN1O15169 862 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 COX4I1P13073 169 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MX2P20592 715 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAN1A1P33908 653 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 RHAGQ02094 409 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 HERC3Q15034 1050 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LGI2Q8N0V4 545 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIMC1Q8NDZ2 872 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDRT15Q96T59 188 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGPAT1Q99943 283 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMOXQ9NWM0 555 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCND2Q9NZV8 630 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAKO14976 1311 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 E9PMD0 336 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 RNF103O00237 685 aa7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRN2O75325 713 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms