RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.28■■□□□ 1.16
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USP40-215ENST00000484528 KCNU1A8MYU2 1149 aa22.27■■□□□ 1.16
USP40-215ENST00000484528 MID1O15344 667 aa22.27■■□□□ 1.16
USP40-215ENST00000484528 PDGFRAP16234 1089 aa22.27■■□□□ 1.16
USP40-215ENST00000484528 GGCXP38435 758 aa22.27■■□□□ 1.16
USP40-215ENST00000484528 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
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USP40-215ENST00000484528 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.27■■□□□ 1.16
USP40-215ENST00000484528 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.27■■□□□ 1.16
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USP40-215ENST00000484528 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.27■■□□□ 1.16
USP40-215ENST00000484528 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.27■■□□□ 1.16
USP40-215ENST00000484528 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
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USP40-215ENST00000484528 CENPCQ03188 943 aa22.26■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 PTK2Q05397 1052 aa22.26■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.26■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 PKD1L2Q7Z442 2459 aa22.25■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 NOX5Q96PH1 765 aa22.25■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa22.24■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.24■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 A0A1B0GVM2 712 aa22.23■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 TCAF2A6NFQ2 919 aa22.23■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 CBFA2T3O75081 653 aa22.23■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 DAB1O75553 588 aa22.23■■□□□ 1.15
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