RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNFRSF8P28908 595 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP51A1Q16850 503 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEPROQ6NW34 567 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIN3Q8TB24 985 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDP2Q9P2J9 529 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRHDEQ9UKU6 1024 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COG5Q9UP83 839 aa16.92■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 URODP06132 367 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YWHAQP27348 245 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL20A1Q9P218 1284 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3BGRLO75368 114 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP1O94782 785 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGI2Q8N0V4 545 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRE3Q9BY15 652 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RERGLQ9H628 205 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CAPN10Q9HC96 672 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H7C4K7 107 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INPP4BO15327 924 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF682O95780 498 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT17P0C025 328 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPR3P17342 541 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HALP42357 657 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPC1P48995 793 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC16Q13042 620 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FKBP6O75344 327 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENTPD5O75356 428 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PGS1Q32NB8 556 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TREML2Q5T2D2 321 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPNE1Q99829 537 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLHL4Q9C0H6 718 aa16.91■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIRTP0C851 137 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DRD4P21917 467 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC153Q494R4 210 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC8BQ6P9F7 803 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNS4Q8IZW8 715 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGAP11Q8TF27 550 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEPT8Q92599 483 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINB11Q96P15 392 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDM4Q9UKN5 801 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLPTM1O96005 669 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPY2RP49146 381 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC34A1Q06495 639 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PARP6Q2NL67 630 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARK4Q96L34 752 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YME1L1Q96TA2 773 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OMDQ99983 421 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RRN3Q9NYV6 651 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F8W810 466 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOA1P02647 267 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC2A4P14672 509 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NFKB1P19838 968 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINB10P48595 397 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A3Q00325 362 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K10Q02779 954 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPANXN3Q5MJ09 141 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.9■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FSBPO95073 299 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MPOP05164 745 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERCC2P18074 760 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMP8P22894 467 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 QPCTQ16769 361 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBCELQ5QJ74 424 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC39Q96DD0 335 aa16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPXM1Q96SM3 734 aa16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms