RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 STAMQ92783 540 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TOP1MTQ969P6 601 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CFAP36Q96G28 342 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TXNDC15Q96J42 360 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 HHIPQ96QV1 700 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DCLK3Q9C098 648 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 VPS33BQ9H267 617 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 HMG20AQ9NP66 347 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 OLFML3Q9NRN5 406 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 THAP1Q9NVV9 213 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GGA1Q9UJY5 639 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KRBA1A5PL33 1030 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 H3BRJ5 948 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SNAP23O00161 211 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 VWA5AO00534 786 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TP73O15350 636 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NUAK1O60285 661 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 BRINP1O60477 761 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KLHL41O60662 606 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TOMM70O94826 608 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ACSL3O95573 720 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KRT3P12035 628 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GZMAP12544 262 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ATF2P15336 505 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TIMP2P16035 220 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PROZP22891 400 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KLRK1P26718 216 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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PKP4-211ENST00000481115 ECT2LQ008S8 904 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ATP1A4Q13733 1029 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ADGRE1Q14246 886 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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PKP4-211ENST00000481115 ERAP2Q6P179 960 aa7.34□□□□□ -1.23
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PKP4-211ENST00000481115 C4orf22Q6V702 233 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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PKP4-211ENST00000481115 BLIDQ8IZY5 108 aa7.34□□□□□ -1.23
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PKP4-211ENST00000481115 CD101Q93033 1021 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TAMM41Q96BW9 452 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ISOC1Q96CN7 298 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 C18orf8Q96DM3 657 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZNF597Q96LX8 424 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 PNMA5Q96PV4 448 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 EYA3Q99504 573 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SYT11Q9BT88 431 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 THTPAQ9BU02 230 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 NAPBQ9H115 298 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
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PKP4-211ENST00000481115 ANKHQ9HCJ1 492 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 STMN3Q9NZ72 180 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ALG6Q9Y672 507 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-211ENST00000481115 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 H0YC42 278 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 I3L4J1 428 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TXNDC9O14530 226 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CLOCKO15516 846 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 COBLO75128 1261 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SPAG6O75602 509 aa7.33□□□□□ -1.24
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