RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 RUBCNQ92622 972 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ISCUQ9H1K1 167 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 TMEM245Q9H330 911 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RAB23Q9ULC3 237 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G4CQ9UP65 541 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 EML5Q05BV3 1969 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CCP110O43303 1012 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CLDN11O75508 207 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 NDUFV2P19404 249 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ADRA1BP35368 520 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CDH4P55283 916 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 OGDHQ02218 1023 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 STARD3Q14849 445 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ALFQ53S48 1182 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 RLN3Q8WXF3 142 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MYO19Q96H55 970 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A17Q9H1V8 727 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PARVAQ9NVD7 372 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD62A6NC57 917 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 E9PAM4 449 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 AP5Z1O43299 807 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MOCS3O95396 460 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ASLP04424 464 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 EPHX1P07099 455 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 P2RY2P41231 377 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PLK1P53350 603 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SLC12A1Q13621 1099 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 PLK5Q496M5 336 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 LRRC31Q6UY01 552 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ALG14Q96F25 216 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-211ENST00000480301 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 RETP07949 1114 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 OXCT1P55809 520 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SARM1Q6SZW1 724 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 DRC7Q8IY82 874 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 CCDC185Q8N715 623 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FRMD1Q8N878 549 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ZNF366Q8N895 744 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 NTAN1Q96AB6 310 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 CNPY3Q9BT09 278 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MPP6Q9NZW5 540 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 NCDNQ9UBB6 729 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 A0A087X0T9 212 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 SRGAP2O75044 1071 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FAM228BP0C875 321 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 BCKDHBP21953 392 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 COPAP53621 1224 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TRIM14Q14142 442 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ARID5BQ14865 1188 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 VPS36Q86VN1 386 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 KDM1BQ8NB78 822 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ZNF653Q96CK0 615 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC7Q99615 494 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TMEM191CA6NGB0 347 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MYBL1P10243 752 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 NUMBP49757 651 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 ECT2LQ008S8 904 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 MANEALQ5VSG8 457 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-211ENST00000480301 TMC6Q7Z403 805 aa21.55■■□□□ 1.04
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