RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 DMWDQ09019 674 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 SEMA3BQ13214 749 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 DCTN1Q14203 1278 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 CSHL1Q14406 222 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 ETFDHQ16134 617 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 LCE1EQ5T753 118 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 MORN5Q5VZ52 161 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 ANO1Q5XXA6 986 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 RINT1Q6NUQ1 792 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 RTL10Q7L3V2 364 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 DEFB132Q7Z7B7 95 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 RFX6Q8HWS3 928 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 CNGA4Q8IV77 575 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 PPM1EQ8WY54 764 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 HMCESQ96FZ2 354 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 VPS50Q96JG6 964 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 SYCP2Q9BX26 1530 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 NLRP1Q9C000 1473 aa3.47□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
TRBV1-201ENST00000476502 CLIP1P30622 1438 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ATP7AQ04656 1500 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 KDM5DQ9BY66 1539 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PRRT4C9JH25 899 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 H0Y3Z8 333 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MATN1P21941 496 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SCP2P22307 547 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 AKT1P31749 480 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 STAT6P42226 847 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 AP2B1P63010 937 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 BFSP2Q13515 415 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 RAPGEF1Q13905 1077 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 KCNB1Q14721 858 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 GALNT15Q8N3T1 639 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SPPL3Q8TCT6 385 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ASB12Q8WXK4 309 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 WASF1Q92558 559 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 HIC2Q96JB3 615 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 NPAS1Q99742 590 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MAF1Q9H063 256 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 VPS33BQ9H267 617 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 IL21RQ9HBE5 538 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SLC22A11Q9NSA0 550 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 LUZP4Q9P127 313 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MSH6P52701 1360 aa3.46□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 DHRS4L1P0CG22 281 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MMP8P22894 467 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CYP3A7P24462 503 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MPGP29372 298 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 HOXD12P35452 270 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ADD2P35612 726 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 GSTM5P46439 218 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SOX2P48431 317 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 AGTR2P50052 363 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TAS2R50P59544 299 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CFHR1Q03591 330 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TLE3Q04726 772 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 P3H2Q8IVL5 708 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PAF1Q8N7H5 531 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms