RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 KNL1Q8NG31 2342 aa13.56□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa13.56□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CETN3O15182 167 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SLC7A4O43246 635 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 MSI1O43347 362 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 LATO43561 262 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 FBXO21O94952 628 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 LTFP02788 710 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CD19P15391 556 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PFKFB1P16118 471 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ACP1P24666 158 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SGSHP51688 502 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 UCNP55089 124 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ECT2LQ008S8 904 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 DNAJC3Q13217 504 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CUL2Q13617 745 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ZCWPW2Q504Y3 356 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 C9orf64Q5T6V5 341 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 WFDC5Q8TCV5 224 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 WBP1Q96G27 269 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CCDC34Q96HJ3 373 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 MRGPRX3Q96LB0 322 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SERPINB11Q96P15 392 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TRIM62Q9BVG3 475 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 EBF2Q9HAK2 575 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CLCA2Q9UQC9 943 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.55□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3EA0A087X179 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3LB9A6J9 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TULP2O00295 520 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 O00370 1275 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SART1O43290 800 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 C1QL1O75973 258 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PAEPP09466 180 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3HP0C7X1 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 GLDCP23378 1020 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SLC6A4P31645 630 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ADPRHP54922 357 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SULT2A1Q06520 285 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 KCNJ12Q14500 433 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PKDCCQ504Y2 493 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 HS1BP3Q53T59 392 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PITRM1Q5JRX3 1037 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 DSG4Q86SJ6 1040 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 LSMEM2Q8N112 164 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CARNMT1Q8N4J0 409 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 HSFY1Q96LI6 401 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 STIM2Q9P246 746 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SERGEFQ9UGK8 458 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 HPSEQ9Y251 543 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TLR6Q9Y2C9 796 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 CEP83Q9Y592 693 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 KALRNO60229 2985 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 KNTC1P50748 2209 aa13.54□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 BPTFQ12830 3046 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 A0A1B0GVL5 298 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ERVH48-1M5A8F1 160 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PRB1P04280 392 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 LCP1P13796 627 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SYKP43405 635 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 OXCT1P55809 520 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 KRT85P78386 507 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 DPYDQ12882 1025 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 TBC1D25Q3MII6 688 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 MS4A13Q5J8X5 152 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 BROXQ5VW32 411 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 FAM46CQ5VWP2 391 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 BEND5Q7L4P6 421 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 AADATQ8N5Z0 425 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 UBA3Q8TBC4 463 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 SLC35F5Q8WV83 523 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 FAM131CQ96AQ9 280 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 FAM129BQ96TA1 746 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 MTG2Q9H4K7 406 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa13.53□□□□□ -0.24
TNS3-211ENST00000474346 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms