RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	KAT2B	Q92831	832 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RRH	O14718	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CYP21A2	P08686	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	XBP1	P17861	261 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TFEB	P19484	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	STAT6	P42226	847 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF84	P51523	738 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RCAN1	P53805	252 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	FOXL2	P58012	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	YPEL5	P62699	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ID2	Q02363	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CFHR1	Q03591	330 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DMWD	Q09019	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GAB1	Q13480	694 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TRPC3	Q13507	836 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	MAF1	Q9H063	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CLK1-208	ENST00000464454	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	AKR1A1	P14550	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	CYP3A7	P24462	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PLCD1	P51178	756 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TAS2R50	P59544	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	VAMP2	P63027	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	CHRND	Q07001	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	MTA1	Q13330	715 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	STIM1	Q13586	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	NPAS1	Q99742	590 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	EYA2	O00167	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	STX16	O14662	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TP73	O15350	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TSPAN3	O60637	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	PEPD	P12955	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TNNT1	P13805	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	CHN1	P15882	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	IGFBP2	P18065	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	TGM2	P21980	687 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	IDUA	P35475	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CLK1-208	ENST00000464454	DDIT3	P35638	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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