RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 NXPE3Q969Y0 559 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SIK2Q9H0K1 926 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLPH3Q9H4A6 298 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 EBF3Q9H4W6 596 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 BRD9Q9H8M2 597 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZWILCHQ9H900 591 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GPAMQ9HCL2 828 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FZD10Q9ULW2 581 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 HS3ST4Q9Y661 456 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NUP205Q92621 2012 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CHADO15335 359 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT86O43790 486 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PALMO75781 387 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LATS1O95835 1130 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 COMTP21964 271 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 IL1R2P27930 398 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MSX1P28360 303 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PCK1P35558 622 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GJC1P36383 396 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SGSHP51688 502 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GAS6Q14393 721 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ACAP1Q15027 740 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PDGFRLQ15198 375 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ADGRF1Q5T601 910 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 C14orf80Q86SX3 495 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DAAM2Q86T65 1068 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CHSY1Q86X52 802 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM25Q86YD3 366 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LGI2Q8N0V4 545 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GJD3Q8N144 294 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 BHMTQ93088 406 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 AZIN2Q96A70 460 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 P2RY11Q96G91 374 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 HPS4Q9NQG7 708 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF358Q9NW07 568 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 LCMT1Q9UIC8 334 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 USP18Q9UMW8 372 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ALG6Q9Y672 507 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 COL4A2P08572 1712 aa8.7□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 COL4A3Q01955 1670 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 NCOR1O75376 2440 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 USP27XA6NNY8 438 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM72CH0Y354 149 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ARNTLO00327 626 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZSCAN12O43309 604 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SPOPO43791 374 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 PRPSAP2O60256 369 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 TBL1XO60907 577 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SRGAP2O75044 1071 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CYP17A1P05093 508 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 RARAP10276 462 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MAN1A1P33908 653 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CHKAP35790 457 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC1A1P43005 524 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SOX9P48436 509 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 RUNX3Q13761 415 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 AUHQ13825 339 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 DHCR24Q15392 516 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 CA9Q16790 459 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ANO4Q32M45 955 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 EFHC2Q5JST6 749 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXL22Q6P050 247 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM72BQ86X60 149 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms