RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 OSBPL2Q9H1P3 480 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 FBXO10Q9UK96 956 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 R4GN57 208 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 COL4A3Q01955 1670 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 KMT2EQ8IZD2 1858 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 TMEM191CA6NGB0 347 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PRRT4C9JH25 899 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SGK1O00141 431 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 NDUFS2O75306 463 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 17.5
PKP4-208ENST00000462335 EPHB2P29323 1055 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 HLA-FP30511 346 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CD70P32970 193 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CSKP41240 450 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 MAGEA1P43355 309 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SGSHP51688 502 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ECT2LQ008S8 904 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 NHLH1Q02575 133 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 LMAN2Q12907 356 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 KRT81Q14533 505 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ELF2Q15723 593 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 C14orf80Q86SX3 495 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 C11orf74Q86VG3 221 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 IGSF8Q969P0 613 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CCDC114Q96M63 670 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PANX2Q96RD6 677 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CHP1Q99653 195 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SYT11Q9BT88 431 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ZWILCHQ9H900 591 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 MPP6Q9NZW5 540 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 COL4A2P08572 1712 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 BNIP3LO60238 219 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 RPP40O75818 363 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 RHOBTB1O94844 696 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CYP1A2P05177 515 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 HOXA6P31267 233 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 L1CAMP32004 1257 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ARL4AP40617 200 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 HDAC4P56524 1084 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 TPI1P60174 286 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 MESP2Q0VG99 397 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ZNF234Q14588 700 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 BOLA3Q53S33 107 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 TRNP1Q6NT89 227 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 RETSATQ6NUM9 610 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 KIAA1328Q86T90 577 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 RHOT2Q8IXI1 618 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 CCDC185Q8N715 623 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 ATP11CQ8NB49 1132 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 FNIP1Q8TF40 1166 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 HSPH1Q92598 858 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 NTAN1Q96AB6 310 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-208ENST00000462335 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms