RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 SGSM3Q96HU1 749 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 FAM20AQ96MK3 541 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CEP89Q96ST8 783 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 MAP7D2Q96T17 732 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ARHGEF4Q9NR80 690 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GPR27Q9NS67 375 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GKN1Q9NS71 199 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 DTLQ9NZJ0 730 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CROTQ9UKG9 612 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 IPPQ9Y573 584 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CDY1Q9Y6F8 540 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 DUSP10Q9Y6W6 482 aa4.74□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 LRBAP50851 2863 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 MSH4O15457 936 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 RRP8O43159 456 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 EDIL3O43854 480 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 MAFKO60675 156 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GAS7O60861 476 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 PSMD10O75832 226 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 HLA-EP13747 358 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 RPL13P26373 211 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TMOD1P28289 359 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 RAB27AP51159 221 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ARPP19P56211 112 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 BNC1Q01954 994 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 RHDQ02161 417 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 SERINC3Q13530 473 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TESK1Q15569 626 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 IGFBP7Q16270 282 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 PHF19Q5T6S3 580 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 SPATC1Q76KD6 591 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 NEK8Q86SG6 692 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ERICH1Q86X53 443 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TBCKQ8TEA7 893 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GTF3C6Q969F1 213 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 MSANTD3Q96H12 275 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CPB2Q96IY4 423 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CDC6Q99741 560 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TEKT3Q9BXF9 490 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CSRNP2Q9H175 543 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 EBF3Q9H4W6 596 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 MTRRQ9UBK8 725 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CBX4O00257 560 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ZNF197O14709 1029 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ADAMTS3O15072 1205 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 BRINP1O60477 761 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TADA3O75528 432 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ABLIM3O94929 683 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 STBD1O95210 358 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 VNN2O95498 520 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 LRG1P02750 347 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GRK2P25098 689 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GRK3P35626 688 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 NEK4P51957 841 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 ROR1Q01973 937 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CREMQ03060 361 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TWF1Q12792 350 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 SLC14A1Q13336 389 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 PPP2R5CQ13362 524 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 MTERF2Q49AM1 385 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 XKR3Q5GH77 459 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 EMC10Q5UCC4 262 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 TEPPQ6URK8 271 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 USP49Q70CQ1 688 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 GAREM2Q75VX8 874 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 FAM124AQ86V42 546 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-204ENST00000461018 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 192.9 ms