RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 CLDN5O00501 218 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 PLIN3O60664 434 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 BEST1O76090 585 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 FYNP06241 537 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 EPHB2P29323 1055 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ELF1P32519 619 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 STON2Q8WXE9 905 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 PCED1BQ96HM7 432 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 NUDCD1Q96RS6 583 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 DDIT4Q9NX09 232 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 SYBUQ9NX95 663 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 STOML1Q9UBI4 398 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.09■□□□□ 0.17
SUCLG2-202ENST00000460567 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 F8W8V4 182 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 UGT1A9O60656 530 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 PEX11AO75192 247 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 RARBP10826 455 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 CYP2B6P20813 491 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 TYK2P29597 1187 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 GRIA1P42261 906 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 NDUFV1P49821 464 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 RAP1GDS1P52306 607 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 KCTD11Q693B1 232 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 FAM171BQ6P995 826 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 C17orf99Q6UX52 265 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 THEM5Q8N1Q8 247 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 TEX9Q8N6V9 391 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 RDH11Q8TC12 318 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 RBBP8Q99708 897 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 DONSONQ9NYP3 566 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.08■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 VGLL3A8MV65 326 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 CAPN14A8MX76 684 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM114B3SHH9 223 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 TPP1O14773 563 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 NRP1O14786 923 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 MLH1P40692 756 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 LIMK2P53671 638 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 CDH17Q12864 832 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 UGP2Q16851 508 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 MBLAC2Q68D91 279 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 HAPLN3Q96S86 360 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.07■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 ARL5CA6NH57 179 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 A8MUI8 341 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 HHLA1C9JL84 531 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 CACNG3O60359 315 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 PROCP04070 461 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 TPBGLP0DKB5 382 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 GNAZP19086 355 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 AOC1P19801 751 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 CCNCP24863 283 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC1A6P48664 564 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 CLCNKBP51801 687 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 AQP5P55064 265 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 BEX3Q00994 111 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 GRIK3Q13003 919 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 UPP1Q16831 310 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 SERINC5Q86VE9 423 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.06■□□□□ 0.16
SUCLG2-202ENST00000460567 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms