RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458646.1

RARB-204, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARB, Length 2,590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-204ENST00000458646 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 ATP2A3Q93084 1043 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 HPDLQ96IR7 371 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 LGMNQ99538 433 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 RAB26Q9ULW5 256 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 FZD1Q9UP38 647 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SBF1O95248 1867 aa6.76□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 BTBD19C9JJ37 291 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 RNF103O00237 685 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 ARIH2O95376 493 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CLPTM1O96005 669 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 LTFP02788 710 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CHRNGP07510 517 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 STAG3L1P0CL83 205 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 MX2P20592 715 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 MPSTP25325 297 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GP5P40197 560 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 PTPN9P43378 593 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 NR2C2P49116 596 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GTF2A2P52657 109 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 LIMK2P53671 638 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 OLIG2Q13516 323 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 ITGA7Q13683 1181 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 MAP7Q14244 749 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 DLG2Q15700 870 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CNGA3Q16281 694 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 AMHR2Q16671 573 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 FSCBQ5H9T9 825 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CES3Q6UWW8 571 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 METTL7BQ6UX53 244 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 TMEM110Q86TL2 294 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 C7orf31Q8N865 590 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 NETO2Q8NC67 525 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 AFG1LQ8WV93 481 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CDKL2Q92772 493 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 ITFG2Q969R8 447 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CERS2Q96G23 380 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 FAM167AQ96KS9 214 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 RBBP8Q99708 897 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CEP41Q9BYV8 373 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 VPS28Q9UK41 221 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 LZTS1Q9Y250 596 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 HES2Q9Y543 173 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 TSC2P49815 1807 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 TMEM114B3SHH9 223 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 TOMM70O94826 608 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 HSPA4LO95757 839 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 AMHP03971 560 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 GOT1P17174 413 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 PSMB4P28070 264 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 TYK2P29597 1187 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SLC5A2P31639 672 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SERPINB5P36952 375 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 MLH1P40692 756 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 ABCG1P45844 678 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CCR10P46092 362 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SERPINB8P50452 374 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CSRP3P50461 194 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CLCN2P51788 898 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CLCN3P51790 818 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 MS4A2Q01362 244 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 FLOT2Q14254 428 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 CCDC153Q494R4 210 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 DSELQ8IZU8 1212 aa6.75□□□□□ -1.33
RARB-204ENST00000458646 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.75□□□□□ -1.33
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