RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440778.5

CCDC18-AS1-212, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NOTCH4Q99466 2003 aa6.71□□□□□ -1.33
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 A0A087X1B8 175 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HIDE1A8MVS5 230 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 I3L4J1 428 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NRP1O14786 923 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CLTAP09496 248 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C1SP09871 688 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PYGMP11217 842 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LAG3P18627 525 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SCP2P22307 547 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PRCPP42785 496 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CYP2J2P51589 502 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HGFACQ04756 655 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GPM6BQ13491 265 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ALCAMQ13740 583 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TBR1Q16650 682 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 JADE1Q6IE81 842 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 OSTM1Q86WC4 334 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ADSSL1Q8N142 457 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 URGCPQ8TCY9 931 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CALML6Q8TD86 181 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 P2RX5Q93086 422 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZNF558Q96NG5 402 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TCHPQ9BT92 498 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZBP1Q9H171 429 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SIX4Q9UIU6 781 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 OBSL1O75147 1896 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PDPK1O15530 556 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LINC01565O15544 149 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 EXTL3O43909 919 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GLP2RO95838 553 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NR3C1P04150 777 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FOSL2P15408 326 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ADCY8P40145 1251 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CLCNKBP51801 687 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CYP24A1Q07973 514 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PTPN14Q15678 1187 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 UPP1Q16831 310 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GPD1LQ8N335 351 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 POF1BQ8WVV4 589 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 SMARCE1Q969G3 411 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ACAP3Q96P50 834 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GBP4Q96PP9 640 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 GSDMAQ96QA5 445 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TMEM175Q9BSA9 504 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 UBN1Q9NPG3 1134 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CBLCQ9ULV8 474 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PATJQ8NI35 1801 aa6.7□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ANO9A1A5B4 782 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 CCDC66A2RUB6 948 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PODXLO00592 558 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 PDXKO00764 312 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 ADAM12O43184 909 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 HCRTO43612 131 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TBX10O75333 385 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 AKAP3O75969 853 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 MPIG6BO95866 241 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 THP07101 528 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRIM49P0CI25 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 TRIM49CP0CI26 452 aa6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC18-AS1-212ENST00000440778 LRPAP1P30533 357 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms