RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 LRRC39Q96DD0 335 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SPON2Q9BUD6 331 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RMND5AQ9H871 391 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 BTBD7Q9P203 1132 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 VAV3Q9UKW4 847 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CHKBQ9Y259 395 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ALOX15BO15296 676 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GSC2O15499 205 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RARBP10826 455 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ECHS1P30084 290 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 FOXN2P32314 431 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NAMPTP43490 491 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TAS2R40P59535 323 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MAMLD1Q13495 774 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CORO6Q6QEF8 472 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GPR141Q7Z602 305 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CYP4X1Q8N118 509 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ALLCQ8N6M5 410 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ASB2Q96Q27 587 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MYH6P13533 1939 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 DFFAO00273 331 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ICAM1P05362 532 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TPBGLP0DKB5 382 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 DAB2P98082 770 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 E2F2Q14209 437 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NFIL3Q16649 462 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 UBA3Q8TBC4 463 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TCF12Q99081 682 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TMEM245Q9H330 911 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CISHQ9NSE2 258 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.5□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 KRT87PA6NCN2 255 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NFIBO00712 420 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MAGEB3O15480 346 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 USP1O94782 785 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MYL4P12829 197 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PSMC3P17980 439 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 HLA-DPA1P20036 260 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GLRA2P23416 452 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 TUBP50607 506 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GTF2BQ00403 316 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CYP1B1Q16678 543 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GSTA3Q16772 222 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 GALNT7Q86SF2 657 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 IRGQQ8WZA9 623 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 PMEPA1Q969W9 287 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 VPS33AQ96AX1 596 aa6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
BDNF-211ENST00000439476 CNDP1Q96KN2 507 aa6.49□□□□□ -1.37
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