RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435348.5

TTC28-AS1-214, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF510Q9Y2H8 683 aa10.37□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SPTA1P02549 2419 aa10.37□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LRRC72A6NJI9 287 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ENO4A6NNW6 628 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TACC1O75410 805 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TBX18O95935 607 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GARTP22102 1010 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 UBA7P41226 1012 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ABL2P42684 1182 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LSSP48449 732 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ST3GAL1Q11201 340 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MCM6Q14566 821 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM35AQ86V20 835 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CXorf38Q8TB03 319 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DDI1Q8WTU0 396 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FIZ1Q96SL8 496 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ABCG4Q9H172 646 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TMEM30AQ9NV96 361 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 INTS13Q9NVM9 706 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CKAP5Q14008 2032 aa10.36□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SERTM1A2A2V5 107 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC26A4O43511 780 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GREM1O60565 184 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAGEC1O60732 1142 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GCNT3O95395 438 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SFTPCP11686 197 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NFKB2Q00653 900 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TYRO3Q06418 890 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BNIP3Q12983 259 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SHBQ15464 509 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 C3orf38Q5JPI3 329 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FYB2Q5VWT5 728 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 XKR5Q6UX68 686 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF720Q7Z2F6 126 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LIMS2Q7Z4I7 341 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SFR1Q86XK3 245 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GPD1LQ8N335 351 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF366Q8N895 744 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NUDT8Q8WV74 236 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SERAC1Q96JX3 654 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TNIP3Q96KP6 325 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CEP63Q96MT8 703 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KRT82Q9NSB4 513 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SCML1Q9UN30 329 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PLXNA2O75051 1894 aa10.35□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CSO75390 466 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IGHV4-34P06331 123 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM163BP0C2L3 166 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RARGP13631 454 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RPS14P62263 151 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ASIC1P78348 528 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TRPC3Q13507 836 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WDR72Q3MJ13 1102 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NCEH1Q6PIU2 408 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 USP30Q70CQ3 517 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 OR5B17Q8NGF7 314 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RAD54LQ92698 747 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 AK8Q96MA6 479 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DCLK3Q9C098 648 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PRM3Q9NNZ6 103 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SEL1LQ9UBV2 794 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RASAL2Q9UJF2 1139 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NAGPAQ9UK23 515 aa10.34□□□□□ -0.75
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM92AA1XBS5 289 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF233A6NK53 670 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TLR4O00206 839 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MDM4O15151 490 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SUV39H1O43463 412 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SDC3O75056 442 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 STC2O76061 302 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WNT1P04628 370 aa10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HMBSP08397 361 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms