RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 NDST4Q9H3R1 872 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 FBXL12Q9NXK8 326 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 COX16Q9P0S2 106 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CACNA1EQ15878 2313 aa15.66■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 LRRC72A6NJI9 287 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SPINK2P20155 84 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CD27P26842 260 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 APBA1Q02410 837 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CST6Q15828 149 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 HLA-BQ31612 363 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 VWA3BQ502W6 1294 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 C1orf216Q8TAB5 229 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 SKA1Q96BD8 255 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 BIRC7Q96CA5 298 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 OMDQ99983 421 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 TMEM51Q9NW97 253 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 RRN3Q9NYV6 651 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 PCNX2A6NKB5 2137 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.65■□□□□ 0.1
HERC3-206ENST00000431413 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GVT2 93 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 TTC34A8MYJ7 566 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 GRAP2O75791 330 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 C1QTNF9P0C862 333 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 NOS2P35228 1153 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 GRIA4P48058 902 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 SLC6A3Q01959 620 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 NME3Q13232 169 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 C9orf64Q5T6V5 341 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 KIAA0895LQ68EN5 471 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 SLC47A2Q86VL8 602 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 APCDD1Q8J025 514 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 MTG2Q9H4K7 406 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 SIX2Q9NPC8 291 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 FZD4Q9ULV1 537 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.64■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 FAM47DPA6NHR8 397 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 FLRT2O43155 660 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 DAB1O75553 588 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 ADH1BP00325 375 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 PDGFRAP16234 1089 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 SLC8A1P32418 973 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 CLCN1P35523 988 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 PLK1P53350 603 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 FAM193AP78312 1265 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 FBXL22Q6P050 247 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa15.63■□□□□ 0.09
HERC3-206ENST00000431413 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms