RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 CST6Q15828 149 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 GLRX5Q86SX6 157 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 DEFB106AQ8N104 65 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 SNX19Q92543 992 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 NOX5Q96PH1 765 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 GAREM1Q9H706 876 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 IL21RQ9HBE5 538 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 TM9SF3Q9HD45 589 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 DDIT4Q9NX09 232 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa21.52■■□□□ 1.04
UBXN4-204ENST00000426921 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1B0GVM2 712 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1B0GVT2 93 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CD27P26842 260 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CCR1P32246 355 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 MTA1Q13330 715 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 HLA-BQ31612 363 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 DBX2Q6ZNG2 339 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PASD1Q8IV76 773 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 APCDD1Q8J025 514 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 KLK13Q9UKR3 277 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ZZEF1O43149 2961 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 TTC34A8MYJ7 566 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 DAB1O75553 588 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ERBB2P04626 1255 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 IGHV4-34P06331 123 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ABCB4P21439 1286 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CLCN1P35523 988 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 VASPP50552 380 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PLK1P53350 603 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 MIIPQ5JXC2 388 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NDST4Q9H3R1 872 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FZD4Q9ULV1 537 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.5■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CHD6Q8TD26 2715 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 MID1O15344 667 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 OXCT1P55809 520 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SNX16P57768 344 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SULT2A1Q06520 285 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 TEAD4Q15561 434 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 KIF19Q2TAC6 998 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FBXL22Q6P050 247 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FAM129BQ96TA1 746 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FSBPO95073 299 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 KRT9P35527 623 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 GALCP54803 685 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SLC6A3Q01959 620 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 VWA3BQ502W6 1294 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PTPRN2Q92932 1015 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms