RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 HMBSP08397 361 aa21.52■■□□□ 1.04
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GPC1-202ENST00000420138 SEPT10Q9P0V9 454 aa21.52■■□□□ 1.04
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GPC1-202ENST00000420138 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GPC1-202ENST00000420138 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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GPC1-202ENST00000420138 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC1-202ENST00000420138 LINC01553A4QN01 128 aa21.48■■□□□ 1.03
GPC1-202ENST00000420138 C2orf78A6NCI8 922 aa21.48■■□□□ 1.03
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