RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 IDH3AP50213 366 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 COPAP53621 1224 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 EFHC1Q5JVL4 640 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPH1Q70E73 1250 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 NT5DC4Q86YG4 428 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNJLQ8IV13 435 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PGBD4Q96DM1 585 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 IFT43Q96FT9 208 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 P2RY11Q96G91 374 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SIKE1Q9BRV8 207 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GPAMQ9HCL2 828 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 USP3Q9Y6I4 520 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 AHCYL1O43865 530 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TOMM70O94826 608 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHL2O95198 593 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PROCP04070 461 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 MLNP12872 115 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC16Q13042 620 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX6Q13608 980 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC30A9Q6PML9 568 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 CMC1Q7Z7K0 106 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPV1Q8NER1 839 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC100653049A0A140TA62 436 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT34O76011 436 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 LMO2P25791 158 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 GRM5P41594 1212 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA9Q13797 1035 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 DBN1Q16643 649 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 IQSEC1Q6DN90 963 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM149B1Q96BN6 582 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-202ENST00000417536 PDPK2PQ6A1A2 396 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 NME8Q8N427 588 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB3Q8N7B9 438 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 HIPK4Q8NE63 616 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC26A7Q8TE54 656 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 COPG2Q9UBF2 871 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GJD2Q9UKL4 321 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP6O75344 327 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 LYNP07948 512 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RALBP11234 206 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP2C9P11712 490 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TNS4Q8IZW8 715 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 S100A14Q9HCY8 104 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 HACD1B0YJ81 288 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CREB3O43889 395 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMPSTE24O75844 475 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CRABP2P29373 138 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SULT1E1P49888 294 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 BCAT1P54687 386 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GSTA3Q16772 222 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP17Q68EM7 881 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TP53INP2Q8IXH6 220 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB106AQ8N104 65 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD52Q8NB46 1076 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KLK14Q9P0G3 267 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJB4Q9UDY4 337 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 STK10O94804 968 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ELNP15502 786 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 MFSD10Q14728 455 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL17Q6UXB2 119 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FZD10Q9ULW2 581 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 BUD23O43709 281 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 USP12O75317 370 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP5P24588 427 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 GRK2P25098 689 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ASPHQ12797 758 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 USP4Q13107 963 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF618Q5T7W0 954 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 HACE1Q8IYU2 909 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC2A14Q8TDB8 520 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP3Q96P47 875 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 MAN1C1Q9NR34 630 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 OPHN1O60890 802 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCG1P45844 678 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-202ENST00000417536 HTRA3P83110 453 aa19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms