RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 A0A1W2PP55 124 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 MID1O15344 667 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PROS1P07225 676 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 ABCB4P21439 1286 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KRT9P35527 623 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PSMD8P48556 350 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 IRAK1P51617 712 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 ZBTB16Q05516 673 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 VWA3BQ502W6 1294 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 MIIPQ5JXC2 388 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 NOX5Q96PH1 765 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 NDST4Q9H3R1 872 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 FHOD1Q9Y613 1164 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa16.05■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 DAB1O75553 588 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CER1O95813 267 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 GLI1P08151 1106 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 VAV1P15498 845 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CCR1P32246 355 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 ECT2LQ008S8 904 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SLC14A1Q13336 389 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CST6Q15828 149 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 HLA-BQ31612 363 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 C9orf64Q5T6V5 341 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 FBXL22Q6P050 247 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 STK40Q8N2I9 435 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 IGSF8Q969P0 613 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SGK2Q9HBY8 427 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CHD8Q9HCK8 2581 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 ITIH6Q6UXX5 1313 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 M0QYT0 321 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 C7P10643 843 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SLC6A3Q01959 620 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KCNMA1Q12791 1236 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KCNJ12Q14500 433 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KIF19Q2TAC6 998 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 RABGAP1LQ5R372 815 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TAF3Q5VWG9 929 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KIAA0895LQ68EN5 471 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 DACH1Q9UI36 760 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.03■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 A0A1B0GVM2 712 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 KCNK3O14649 394 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 IGHV4-34P06331 123 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 FTH1P19P0C7X4 201 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SLC2A3P11169 496 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 CD27P26842 260 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SLC8A1P32418 973 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 SULT1E1P49888 294 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 TEAD4Q15561 434 aa16.02■□□□□ 0.16
ACTB-202ENST00000414620 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa16.02■□□□□ 0.16
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