RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 SIN3BO75182 1162 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 GLRA3O75311 464 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 GCATO75600 419 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 BEX3Q00994 111 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 CUL3Q13618 768 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 RALGPS1Q5JS13 557 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 PGM2L1Q6PCE3 622 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 RNF111Q6ZNA4 994 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 JADE3Q92613 823 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 OLFM3Q96PB7 478 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF670Q9BS34 389 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 SNX25Q9H3E2 840 aa25.17■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 LCP1P13796 627 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 PNPLA4P41247 253 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 RPL34P49207 117 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 CPT1AP50416 773 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 RPS6KA3P51812 740 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 BTKQ06187 659 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 CCNIQ14094 377 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 CFAP157Q5JU67 520 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 FAM96AQ9H5X1 160 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 TAF6P49848 677 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 XIAPP98170 497 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 SFT2D3Q587I9 215 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 APPL2Q8NEU8 664 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 ACTRT2Q8TDY3 377 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 SLC26A7Q8TE54 656 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.16■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 MYL4P12829 197 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 UQCRBP14927 111 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 MED21Q13503 144 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 KLHL4Q9C0H6 718 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJC28Q9NX36 388 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 IPPQ9Y573 584 aa25.15■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 PLIN3O60664 434 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 SERPINE1P05121 402 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 KCNA4P22459 653 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 GRIA1P42261 906 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 EPHB1P54762 984 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 STEAP4Q687X5 459 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 MAVSQ7Z434 540 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 ARRDC4Q8NCT1 418 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 CDH22Q9UJ99 828 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa25.14■■□□□ 1.62
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF487B1APH4 448 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ALDH1A2O94788 518 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PROCP04070 461 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SCNN1AP37088 669 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PCLAFQ15004 111 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC33Q8N5R6 958 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PPP4R1Q8TF05 950 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ATP2A3Q93084 1043 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.14■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 TPP1O14773 563 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CYP2F1P24903 491 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 IDH3AP50213 366 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SEMA5AQ13591 1074 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 DPYSL2Q16555 572 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC36Q1X8D7 754 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SV2CQ496J9 727 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 LPCAT4Q643R3 524 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 VCX3AQ9NNX9 186 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ACADSBP45954 432 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 NIPAL4Q0D2K0 466 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CMTM5Q96DZ9 223 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 HSFY1Q96LI6 401 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 SORT1Q99523 831 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEB5Q9BZ81 275 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 DCDC2Q9UHG0 476 aa25.13■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 HUS1O60921 280 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PDE5AO76074 875 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 CYP2B6P20813 491 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 GRK2P25098 689 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 LILRA4P59901 499 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 GRM2Q14416 872 aa25.12■■□□□ 1.61
FAAP20-206ENST00000414253 PDPK2PQ6A1A2 396 aa25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms