RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TMEM143Q96AN5 459 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CHP1Q99653 195 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CRACR2AQ9BSW2 395 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 STK33Q9BYT3 514 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 POLD4Q9HCU8 107 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.96□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.96□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CTAGE9A4FU28 777 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZNF233A6NK53 670 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TISP43B9A030 160 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 TOM1L1O75674 476 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 F2P00734 622 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LRG1P02750 347 aa6.95□□□□□ -1.3
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CCL20-202ENST00000409189 LCP1P13796 627 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SLC9A1P19634 815 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SOX5P35711 763 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GPC3P51654 580 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 AP3M2P53677 418 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP8P85298 464 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GCNT1Q02742 428 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LSAMPQ13449 338 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PSMD6Q15008 389 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CDSNQ15517 529 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MAPK6Q16659 721 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DGKDQ16760 1214 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DDR2Q16832 855 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SV2CQ496J9 727 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 C1orf220Q5T0J3 134 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 STEAP3Q658P3 488 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SERINC5Q86VE9 423 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TRIM58Q8NG06 486 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 SAAL1Q96ER3 474 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MAP7D2Q96T17 732 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 CGRRF1Q99675 332 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NCDNQ9UBB6 729 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NENFQ9UMX5 172 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 WASF3Q9UPY6 502 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NR2E1Q9Y466 385 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.95□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 A0A0B4J269 797 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 K7ERI5 159 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 ZNF263O14978 683 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DGKIO75912 1065 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PRKCBP05771 671 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GLULP15104 373 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PROZP22891 400 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TMOD1P28289 359 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GCLMP48507 274 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GATMP50440 423 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 MCL1Q07820 350 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PPP3CAQ08209 521 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 PPFIA1Q13136 1202 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KYAT1Q16773 422 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 FAM187BQ17R55 369 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.94□□□□□ -1.3
CCL20-202ENST00000409189 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.94□□□□□ -1.3
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