RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 DPH6Q7L8W6 267 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 NUP93Q8N1F7 819 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF366Q8N895 744 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 EXD3Q8N9H8 876 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDZD8Q8NEN9 1154 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR5B17Q8NGF7 314 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCNE4Q8WWG9 221 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 RFFLQ8WZ73 363 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 OVCA2Q8WZ82 227 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 HPDLQ96IR7 371 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 C8orf76Q96K31 380 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCNK16Q96T55 309 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 CEP41Q9BYV8 373 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELOVL4Q9GZR5 314 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 NACA2Q9H009 215 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 LHX5Q9H2C1 402 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZHX3Q9H4I2 956 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 EBF2Q9HAK2 575 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 PDE11AQ9HCR9 933 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 OSER1Q9NX31 292 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM13BQ9NYF5 915 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 IL37Q9NZH6 218 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 WDR35Q9P2L0 1181 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTPN13Q12923 2485 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 MGAQ8IWI9 3026 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 FAM92AA1XBS5 289 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 HMX2A2RU54 273 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 K7ENP7 123 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 WNT9AO14904 365 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 VILLO15195 856 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLK10O43240 276 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 DFNA5O60443 496 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 MT-CO3P00414 261 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLKB1P03952 638 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 EPHX1P07099 455 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDK4P11802 303 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ABCB4P21439 1286 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCP2P22307 547 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 SCNN1AP37088 669 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF132P52740 706 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 C21orf59P57076 290 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPS14P62263 151 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 GABREP78334 506 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 BNIP3Q12983 259 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 TMEM164Q5U3C3 297 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 SFMBT2Q5VUG0 894 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 PAQR9Q6ZVX9 377 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 SFR1Q86XK3 245 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZMIZ2Q8NF64 920 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR2T3Q8NH03 318 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 MMS19Q96T76 1030 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 INTS13Q9NVM9 706 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELOVL2Q9NXB9 296 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A1W2PPC4 97 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A1W2PR77 199 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-398P-201ENST00000384143 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms