RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 NOTCH2Q04721 2471 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 CLIP1P30622 1438 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 NCOA2Q15596 1464 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 SYNJ1O43426 1573 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 TRAF2Q12933 501 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 PMS2CLQ68D20 193 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF367Q7RTV3 350 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 ABCC8Q09428 1581 aa4.36□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 CNTN5O94779 1100 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 PMPCAQ10713 525 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 FCN2Q15485 313 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-202ENST00000367364 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 KDM5BQ9UGL1 1544 aa4.35□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 KAT7O95251 611 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 APOLD1Q96LR9 279 aa4.34□□□□□ -1.71
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC6Q16204 474 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-202ENST00000367364 STPG1Q5TH74 334 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.33□□□□□ -1.72
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PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.33□□□□□ -1.72
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC88BA6NC98 1476 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-202ENST00000367364 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRC-202ENST00000367364 MS4A18H0YCH9 400 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-202ENST00000367364 VWA5AO00534 786 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRC-202ENST00000367364 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-202ENST00000367364 TPH2Q8IWU9 490 aa4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-202ENST00000367364 TCP11L2Q8N4U5 519 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-202ENST00000367364 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA20Q8TB22 786 aa4.31□□□□□ -1.72
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