RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006777.10

RHBDD2-201, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-201ENST00000006777 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 MIB1Q86YT6 1006 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 RABGEF1Q9UJ41 708 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 MAFFQ9ULX9 164 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 SLC12A8A0AV02 714 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 IRAK1P51617 712 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 NR1H3Q13133 447 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF534Q76KX8 674 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PTPRSQ13332 1948 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 AVILO75366 819 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 GSTA2P09210 222 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CCNCP24863 283 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PSMB4P28070 264 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ALDH1A3P47895 512 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CREMQ03060 361 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 TEX44Q53QW1 395 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 NUGGCQ68CJ6 796 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 C14orf80Q86SX3 495 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CEP41Q9BYV8 373 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.98■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 GCAP28676 217 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 GUCY1A3Q02108 690 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 MTM1Q13496 603 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 AFMIDQ63HM1 303 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 IGDCC3Q8IVU1 814 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF683Q8IZ20 524 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 FBF1Q8TES7 1133 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 DPF3Q92784 378 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 MYRFLQ96LU7 910 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 DNMT3LQ9UJW3 386 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 YIPF1Q9Y548 306 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.97■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 DFFAO00273 331 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 RHOQP17081 205 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 VEPH1Q14D04 833 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CYTH2Q99418 400 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZYG11BQ9C0D3 744 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 GBA3Q9H227 469 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 DOCK4Q8N1I0 1966 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZBBXA8MT70 800 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 CPP00450 1065 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 FGBP02675 491 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ELF1P32519 619 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 STX2P32856 288 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 NLRP14Q86W24 1093 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 MPP6Q9NZW5 540 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 TBK1Q9UHD2 729 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.96■■□□□ 1.11
RHBDD2-201ENST00000006777 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 GJB5O95377 273 aa21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 PPP3CCP48454 512 aa21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 ZBTB17Q13105 803 aa21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 TMED2Q15363 201 aa21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 TAF12Q16514 161 aa21.95■■□□□ 1.1
RHBDD2-201ENST00000006777 HECTD3Q5T447 861 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms