RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218553.1

Ptprb-203, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Ptprb, Length 7,016 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Tfdp2Q64163 446 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Tmeff1Q6PFE7 372 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ip6k2Q80V72 448 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Snrnp25Q8VIK1 123 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Golga1Q9CW79 758 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Jph3Q9ET77 744 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Dyrk1bQ9Z188 629 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Spag17Q5S003 2320 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Zbed5B2RPU8 756 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 EdnrbP48302 442 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 InhbaQ04998 424 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Tmem102Q3UPR7 509 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Nuak1Q641K5 658 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Shc2Q8BMC3 573 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 CptpQ8BS40 216 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Tmx1Q8VBT0 278 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Cacng4Q9JJV4 327 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Plod1Q9R0E2 728 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gm42957D6RFQ2 366 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gm8994E9PV04 411 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Nr1i3O35627 358 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Rgs9O54828 675 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ncf2O70145 525 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Cd160O88875 185 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Vps41Q5KU39 853 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Msantd2Q6NZR2 559 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Znf423Q80TS5 1292 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Klhl28Q9CR40 571 aa8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ccdc13D3YV10 709 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gm7995L7N2E4 160 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Adra1dP97714 562 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Tmem161bQ8C2L6 487 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Vps18Q8R307 973 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Pcdhb10Q91VE5 797 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Pcdhb16Q91Y03 802 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Scrn1Q9CZC8 414 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 UxtQ9WTZ0 157 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Lgals7O54974 136 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Hoxd12P23812 268 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 CryabP23927 175 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Opa1P58281 960 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Actr1aP61164 376 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gjb6P70689 261 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 PrkcqQ02111 707 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gm1587Q3UT80 123 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Hepacam2Q4VAH7 463 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 MarcoQ60754 518 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 PterQ60866 349 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gpr142Q7TQN9 365 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Znf426Q8R1D1 550 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Actr1bQ8R5C5 376 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Olfr853Q8VGG6 305 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gps2Q921N8 327 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Rab13Q9DD03 202 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Vav3Q9R0C8 847 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Trpc2Q9R244 1172 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gon4lQ9DB00 2260 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Zfp990B1AVN5 605 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Vmn2r27D3YUK6 857 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Adra2bP30545 450 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 AxlQ00993 888 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ttf2Q5NC05 1138 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Panx2Q6IMP4 677 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Znf821Q6PD05 413 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 GnasQ6R0H7 1133 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Mettl21cQ8BLU2 248 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Q922R1 422 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Psmd12Q9D8W5 456 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Gtf2e2Q9D902 292 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Vps45P97390 570 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Lrig2Q52KR2 1054 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 PmlQ60953 885 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Hesx1Q61658 185 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Usp7Q6A4J8 1103 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Arhgap11aQ80Y19 987 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Prr11Q8BHE0 368 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Lrrc42Q8R2U7 421 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Efhc2Q9D485 750 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa8.49□□□□□ -1.05
Ptprb-203ENSMUST00000218553 Ifnar1P33896 590 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.8 ms