RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1415Q7TQS4 311 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ints8Q80V86 995 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adam29Q811Q4 763 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Aste1Q8BIR2 672 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfm2Q8BM13 448 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc187Q8C5V8 958 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fbxo43Q8CDI2 640 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Clec4a3Q8JZX6 237 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wipf1Q8K1I7 493 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zdhhc3Q8R173 299 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1416Q8VGU4 312 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hdac8Q8VH37 377 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcdhb15Q91Y04 786 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcdha9Q91Y11 979 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ube2sQ921J4 223 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Npffr2Q924H0 417 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Brms1Q99N20 246 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trmt10bQ9D075 318 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dlgap1Q9D415 992 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dusp10Q9ESS0 483 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adrm1Q9JKV1 407 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igbp1bQ9QZ29 343 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 DexiQ9WUQ7 95 aa8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Knop1Q9Z2Q2 478 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vwa8Q8CC88 1905 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prdm12A2AJ77 365 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prr36E9PV26 1098 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r88E9Q235 316 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm3233E9Q2H5 230 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spata31E9QAF0 1014 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 LdhcP00342 332 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prl2c3P04768 224 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PfklP12382 780 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc2a4P14142 509 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 F9P16294 471 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Anxa5P48036 319 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Frmd8Q3UFK8 466 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gfod1Q3UHD2 390 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Defb28Q3V2L0 89 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nr2c1Q505F1 590 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 CttnQ60598 546 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nab2Q61127 525 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Creb3Q61817 404 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gstt1Q64471 240 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prl3a1Q78Y73 227 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr212Q7TS33 327 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Noc4lQ8BHY2 516 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf787Q8BIF9 381 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gpatch3Q8BIY1 525 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Spon2Q8BMS2 330 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc7a14Q8BXR1 771 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fam221aQ8C790 301 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wdr24Q8CFJ9 790 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bbs7Q8K2G4 715 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ace2Q8R0I0 805 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AdigQ8R400 80 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tbc1d19Q8VDV7 526 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nle1Q8VEJ4 485 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ipo4Q8VI75 1082 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcdha11Q91Y19 950 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif17Q99PW8 1038 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scyl3Q9DBQ7 735 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dach1Q9QYB2 751 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm3854A0A1B0GSS6 495 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Acnat1A2AKK5 416 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 BC051665E9Q623 330 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1022L7MTT3 315 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nedd9O35177 833 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Opn1mwO35599 359 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cetn3O35648 167 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 RngttO55236 597 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 TceancQ3US16 359 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Odr4Q4PJX1 447 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rhox12Q4TU81 186 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cldn11Q60771 207 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krt31Q61765 416 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ppp2r2aQ6P1F6 447 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp251Q6PCX8 632 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf821Q6PD05 413 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr26Q7TRB7 308 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr527Q7TRT9 305 aa7.98□□□□□ -1.13
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Efcab14Q8BGQ6 484 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.4 ms