RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021288.9

Usp43-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp43, Length 4,462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43-201ENSMUST00000021288 HiraQ61666 1015 aa15.64■□□□□ 0.1
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ftsj1Q8CBC7 324 aa15.64■□□□□ 0.1
Usp43-201ENSMUST00000021288 Zfp263Q8CF60 680 aa15.64■□□□□ 0.1
Usp43-201ENSMUST00000021288 TgdsQ8VDR7 355 aa15.64■□□□□ 0.1
Usp43-201ENSMUST00000021288 PllpQ9DCU2 182 aa15.64■□□□□ 0.1
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ifi30Q9ESY9 248 aa15.64■□□□□ 0.1
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm6205E9PZS2 359 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 PdgfrbP05622 1098 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 ItgalP24063 1163 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gp1bbP56400 206 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Q14AM7 275 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Snx27Q3UHD6 539 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Traf3Q60803 567 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Hspa1aQ61696 641 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 MelkQ61846 643 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Syn2Q64332 586 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Disc1Q811T9 852 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Dyrk4Q8BI55 632 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gm6367Q8C6L9 287 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rdh13Q8CEE7 334 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Akr1c20Q8VC77 323 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Txndc9Q9CQ79 226 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tmem79Q9D709 391 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Med20Q9R0X0 212 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Col4a1P02463 1669 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Arhgef10Q8C033 1345 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Kifc5bE9PUA5 672 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Prdm15E9Q8T2 1174 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 2210016F16RikG3X8U3 338 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Akap14Q3V0I7 536 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Adora2bQ60614 332 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Gpsm1Q6IR34 673 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Stx5Q8K1E0 355 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Hdhd5Q91WM2 419 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Q922M7 232 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Cyp2c55Q9D816 490 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 PignQ9R1S3 931 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Myh7Q91Z83 1935 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 PtprvP70289 1705 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 RerglB2RVE2 204 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Slc16a1P53986 493 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Polr1bP70700 1135 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tarbp2P97473 365 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Cyp2c65Q148B1 490 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Trim17Q7TPM3 477 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fnip2Q80TD3 1108 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Zdhhc17Q80TN5 632 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Il17reQ8BH06 637 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 P3h2Q8CG71 703 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Acad10Q8K370 1069 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Arhgef25Q9CWR0 618 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tlr6Q9EPW9 795 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Slc15a2Q9ES07 729 aa15.64■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Kndc1Q0KK55 1742 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Irf3P70671 419 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fam131bQ3TY60 332 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Serac1Q3U213 654 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 ChpfQ6IQX7 774 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Usp6nlQ80XC3 819 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tigd4Q8BUZ3 513 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Dlk2Q8K1E3 382 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Guca1bQ8VBV8 201 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 MutyhQ99P21 515 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 PudpQ9D5U5 234 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Mpp6Q9JLB0 553 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Aldoart1A6ZI46 419 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 D3Z070 196 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Kifc3O35231 824 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Dpep1P31428 410 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Timm13P62075 95 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Zbtb14Q08376 449 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Syce2Q505B8 171 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Q5XFZ0 217 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Tmem130Q6NXM3 419 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Parp6Q6P6P7 630 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Znf821Q6PD05 413 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Slc41a1Q8BJA2 512 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Rftn2Q8CHX7 500 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fam83aQ8K2P2 436 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Snx15Q91WE1 337 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Nxnl2Q9D531 156 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Vmn2r5K7N788 911 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Vps50Q8CI71 964 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Acvr1cQ8K348 493 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Fam151aQ8QZW3 608 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Ppp1r14cQ8R4S0 164 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 AenQ9CZI9 336 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Kctd4Q9D7X1 259 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 Snx5Q9D8U8 404 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 PigqQ9QYT7 581 aa15.63■□□□□ 0.09
Usp43-201ENSMUST00000021288 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.3 ms