RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 FBXL22Q6P050 247 aa23.11■■□□□ 1.29
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SYT6-210ENST00000641643 CD248Q9HCU0 757 aa23.11■■□□□ 1.29
SYT6-210ENST00000641643 VANGL2Q9ULK5 521 aa23.11■■□□□ 1.29
SYT6-210ENST00000641643 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa23.11■■□□□ 1.29
SYT6-210ENST00000641643 HS3ST4Q9Y661 456 aa23.11■■□□□ 1.29
SYT6-210ENST00000641643 LRRC53A6NM62 1247 aa23.1■■□□□ 1.29
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SYT6-210ENST00000641643 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
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SYT6-210ENST00000641643 SEMA4GQ9NTN9 838 aa23.1■■□□□ 1.29
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SYT6-210ENST00000641643 TTC17Q96AE7 1141 aa23.08■■□□□ 1.29
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SYT6-210ENST00000641643 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa23.07■■□□□ 1.28
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SYT6-210ENST00000641643 IGSF8Q969P0 613 aa23.07■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SIPA1Q96FS4 1042 aa23.07■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 SUN2Q9UH99 717 aa23.07■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa23.06■■□□□ 1.28
SYT6-210ENST00000641643 ACADMP11310 421 aa23.06■■□□□ 1.28
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