RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ARID5A	Q03989	594 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SMARCB1	Q12824	385 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	IFT43	Q96FT9	208 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PGBD1	Q96JS3	809 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF358	Q9NW07	568 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SCML1	Q9UN30	329 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DMTF1	Q9Y222	760 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PP55	124 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	LAT	O43561	262 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CISD3	P0C7P0	127 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SFN	P31947	248 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT1	P36639	197 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	STAT5A	P42229	794 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	JAK3	P52333	1124 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP2CB	P62714	309 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP2CA	P67775	309 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	MYL7	Q01449	175 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNAB1	Q14722	419 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CDSN	Q15517	529 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	LMX1A	Q8TE12	382 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	BTRC	Q9Y297	605 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ZAN	Q9Y493	2812 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PIPSL	A2A3N6	862 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ARGFX	A6NJG6	315 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM86B1	E9PN63	330 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	HIP1	O00291	1037 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXP2	O15409	715 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGEF9	O43307	516 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	KATNA1	O75449	491 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RAF1	P04049	648 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TYMP	P19971	482 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	F8A1	P23610	371 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	DLST	P36957	453 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RFC5	P40937	340 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	POU5F1B	Q06416	359 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	MYBPH	Q13203	477 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNJL	Q8IV13	435 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	OMD	Q99983	421 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	CIPC	Q9C0C6	399 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF32	Q9H0A6	362 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF38	Q9H0F5	515 aa		6.6	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms