RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 NOS2P35228 1153 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 TPMTP51580 245 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 COPAP53621 1224 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 PTPRNQ16849 979 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 FOXJ1Q92949 421 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 C18orf8Q96DM3 657 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 F8VZ95 297 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 M0QYT0 321 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 HOXD12P35452 270 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 CSKP41240 450 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 KLK7P49862 253 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 MYL5Q02045 173 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 FSCBQ5H9T9 825 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 GPR174Q9BXC1 333 aa21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 DAB1O75553 588 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 GFPT2O94808 682 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 ASLP04424 464 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 MAPK8P45983 427 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 RABGAP1LQ5R372 815 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 FAM124AQ86V42 546 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 TTC17Q96AE7 1141 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 LMLNQ96KR4 655 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 NUP58Q9BVL2 599 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.84■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 MEI4A8MW99 385 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 TM4SF5O14894 197 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 MMEP08473 750 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 MATKP42679 507 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 SPAG5Q96R06 1193 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 GANQ9H2C0 597 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 RRN3Q9NYV6 651 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.83■■□□□ 1.09
TIMM50-216ENST00000601358 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 GNSP15586 552 aa21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 ENGP17813 658 aa21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 MTA1Q13330 715 aa21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 SIK2Q9H0K1 926 aa21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 WDCPQ9H6R7 721 aa21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 FBRSQ9HAH7 460 aa21.83■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 NUMA1Q14980 2115 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 DNTTP04053 509 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 SERPINF2P08697 491 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 MAOBP27338 520 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 GABRB2P47870 512 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 SULT1E1P49888 294 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 ECT2LQ008S8 904 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 C2CD6Q53TS8 623 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 NAA35Q5VZE5 725 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 FBXL22Q6P050 247 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 NEK11Q8NG66 645 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 FSCN3Q9NQT6 498 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 ERVW-1Q9UQF0 538 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM50-216ENST00000601358 SOX5P35711 763 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms