RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 SUN2Q9UH99 717 aa24.1■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.1■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 IGF2RP11717 2491 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 A0A1B0GTW7 788 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 SLC2A3P11169 496 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 CDK17Q00537 523 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 VWA3BQ502W6 1294 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 MIIPQ5JXC2 388 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 LGI2Q8N0V4 545 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 CFAP52Q8N1V2 620 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.09■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.458e-11■■■■□ 21.9
MBD3-211ENST00000592965 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 TACR2P21452 398 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 ARID5BQ14865 1188 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 FSCBQ5H9T9 825 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 FAM124AQ86V42 546 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa24.08■■□□□ 1.45
MBD3-211ENST00000592965 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 GJB3O75712 270 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 CLCN1P35523 988 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SNX16P57768 344 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ST8SIA6P61647 398 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 GRIK2Q13002 908 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 DEFB106AQ8N104 65 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 OR2I1PQ8NGU4 316 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 DDIT4Q9NX09 232 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 WASF3Q9UPY6 502 aa24.07■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 AKAP13Q12802 2813 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 F5H5T6 163 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 H0Y626 953 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 MOCS3O95396 460 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 DNTTP04053 509 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 CCR1P32246 355 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 KRT9P35527 623 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 BPIFB4P59827 614 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SLC14A1Q13336 389 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 PTPN20Q4JDL3 420 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 C1orf216Q8TAB5 229 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 CEP83Q9Y592 693 aa24.06■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 DAB1O75553 588 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ERBB2P04626 1255 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 CD59P13987 128 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ACSL1P33121 698 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 MTA1Q13330 715 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 MTG2Q9H4K7 406 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SCML1Q9UN30 329 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ERVW-1Q9UQF0 538 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ITIH6Q6UXX5 1313 aa24.05■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SIN3BO75182 1162 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 GRAP2O75791 330 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SEMA4FO95754 770 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ABCB4P21439 1286 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SLC6A3Q01959 620 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 FOXC1Q12948 553 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 SLC12A1Q13621 1099 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 KCNJ12Q14500 433 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 USP30Q70CQ3 517 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 BTBD1Q9H0C5 482 aa24.04■■□□□ 1.44
MBD3-211ENST00000592965 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms